Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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249 Thomsonite (Na2O)(CaO)4(Al2O3)5(SiO2)10(H2O)12

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    13.25  13.06  13.10  90.00  90.00  90.00   2266.5   2.364
                                       PM6:    13.69  13.57  12.74  80.70  75.83  84.23   2259.4   2.371

                 X-Ray                               PM6

X-Ray data set: MERS=(1,1,1) 1SCF DERIV Thomsonite Ca 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1 0.0000 Na 0.77600000 +1 -6.1510000 +1 -1.8630000 +1 0.0000 Ca -5.77600000 +1 0.2800000 +1 -4.7820000 +1 0.0000 Ca -0.75300000 +1 -6.1510000 +1 -4.7820000 +1 0.0000 Na 5.79900000 +1 0.2800000 +1 -1.8630000 +1 0.0000 Na -0.75300000 +1 -6.2490000 +1 1.8410010 +1 0.0000 Ca 5.79900000 +1 0.3780000 +1 4.7600000 +1 0.0000 Ca 0.77600000 +1 -6.2490000 +1 4.7600000 +1 0.0000 Na -5.77600000 +1 0.3780000 +1 1.8410010 +1 0.0000 Ca -6.55200000 +1 -6.5290000 +1 -0.0220000 +1 0.0000 Ca 0.00000000 +1 0.6580000 +1 6.6240010 +1 0.0000 Ca -6.55200000 +1 -5.8710000 +1 6.6020010 +1 0.0000 Si 3.28700000 +1 3.5930000 +1 2.4810000 +1 0.0000 Al 3.28700000 +1 -2.9350000 +1 2.5090000 +1 0.0000 Si 1.49200000 +1 -3.6580000 +1 -0.0080000 +1 0.0000 Al 1.57700000 +1 4.3290000 +1 -0.0660000 +1 0.0000 Si 4.05800000 +1 5.3540000 +1 -1.6350000 +1 0.0000 Al 4.07500000 +1 -4.5810000 +1 -1.5990000 +1 0.0000 O 2.22900000 +1 4.4000000 +1 1.5520000 +1 0.0000 O 2.09000000 +1 -3.7130000 +1 1.5010000 +1 0.0000 O 4.12300000 +1 4.6490000 +1 3.3820000 +1 0.0000 O 4.11300000 +1 -4.1420000 +1 3.4640000 +1 0.0000 O 0.03900000 +1 -4.4150000 +1 0.0060000 +1 0.0000 O 2.42000000 +1 -4.5140000 +1 -1.0310000 +1 0.0000 O 2.50600000 +1 5.3590000 +1 -1.1310000 +1 0.0000 O 1.37800000 +1 -2.1180000 +1 -0.5240000 +1 0.0000 O 1.56100000 +1 2.6900000 +1 -0.6380000 +1 0.0000 O 4.68900000 +1 6.8490000 +1 -1.5610000 +1 0.0000 O 4.34600000 +1 2.7860000 +1 1.5520000 +1 0.0000 O 2.45100000 +1 2.5370000 +1 3.3820000 +1 0.0000 O 5.01300000 +1 4.4970000 +1 -0.6380000 +1 0.0000 Si 2.51600000 +1 1.8330000 +1 -1.6350000 +1 0.0000 O 4.48400000 +1 -2.1580000 +1 1.5010000 +1 0.0000 O 2.46100000 +1 -1.7290000 +1 3.4640000 +1 0.0000 O 5.19700000 +1 -3.7520000 +1 -0.5240000 +1 0.0000 Al 2.49900000 +1 -1.2890000 +1 -1.5990000 +1 0.0000 O -0.01700000 +1 5.0730000 +1 -0.0280000 +1 0.0000 Al -1.55500000 +1 -3.6710000 +1 0.0440000 +1 0.0000 O 4.11300000 +1 4.8000000 +1 -3.1590000 +1 0.0000 O 4.12300000 +1 -3.9910000 +1 -3.2410000 +1 0.0000 Al 4.07500000 +1 5.2390000 +1 5.0240000 +1 0.0000 Si 4.05800000 +1 -4.6960000 +1 4.9880000 +1 0.0000 Si 5.08200000 +1 -2.2130000 +1 -0.0080000 +1 0.0000 Al 4.99700000 +1 2.8570000 +1 -0.0660000 +1 0.0000 O 6.53500000 +1 -1.4550000 +1 0.0060000 +1 0.0000 O 4.15400000 +1 -1.3570000 +1 -1.0310000 +1 0.0000 O 4.06800000 +1 1.8270000 +1 -1.1310000 +1 0.0000 O 1.88500000 +1 0.3380000 +1 -1.5610000 +1 0.0000 O -6.51300000 +1 2.1130000 +1 -0.0280000 +1 0.0000 Al -4.97500000 +1 -2.1990000 +1 0.0440000 +1 0.0000 O 2.46100000 +1 2.3870000 +1 -3.1590000 +1 0.0000 O 2.45100000 +1 -1.8790000 +1 -3.2410000 +1 0.0000 Al 2.49900000 +1 1.9470000 +1 5.0240000 +1 0.0000 Si 2.51600000 +1 -1.1750000 +1 4.9880000 +1 0.0000 Si -3.26500000 +1 3.5930000 +1 4.1210000 +1 0.0000 Al -3.26500000 +1 -2.9350000 +1 4.0920000 +1 0.0000 Si -5.06000000 +1 -2.2130000 +1 6.6100010 +1 0.0000 Al -4.97500000 +1 2.8570000 +1 -6.5800010 +1 0.0000 Si -2.49300000 +1 1.8330000 +1 -5.0110010 +1 0.0000 Al -2.47700000 +1 -1.2890000 +1 -5.0470010 +1 0.0000 O -4.32300000 +1 2.7860000 +1 5.0500000 +1 0.0000 O -4.46200000 +1 -2.1570000 +1 5.1000000 +1 0.0000 O -2.42900000 +1 2.5370000 +1 3.2200000 +1 0.0000 O -2.43900000 +1 -1.7290000 +1 3.1370000 +1 0.0000 O -6.51300000 +1 -1.4550000 +1 6.5960000 +1 0.0000 O -4.13200000 +1 -1.3570000 +1 7.6330000 +1 0.0000 O -4.04600000 +1 1.8270000 +1 -5.5150010 +1 0.0000 O -5.17400000 +1 -3.7520000 +1 7.1260000 +1 0.0000 O -4.99100000 +1 4.4970000 +1 -6.0080010 +1 0.0000 O -1.86200000 +1 0.3380000 +1 -5.0840010 +1 0.0000 O -2.20600000 +1 4.4000000 +1 5.0500000 +1 0.0000 O -4.10000000 +1 4.6490000 +1 3.2200000 +1 0.0000 O -1.53900000 +1 2.6900000 +1 -6.0080010 +1 0.0000 Si -4.03600000 +1 5.3540000 +1 -5.0110010 +1 0.0000 O -2.06800000 +1 -3.7130000 +1 5.1000000 +1 0.0000 O -4.09000000 +1 -4.1420000 +1 3.1370000 +1 0.0000 O -1.35500000 +1 -2.1180000 +1 7.1260000 +1 0.0000 Al -4.05300000 +1 -4.5810000 +1 -5.0470010 +1 0.0000 O 6.53500000 +1 2.1130000 +1 6.6290000 +1 0.0000 Al 4.99700000 +1 -2.1990000 +1 6.5570000 +1 0.0000 O -2.43900000 +1 2.3870000 +1 -3.4870020 +1 0.0000 O -2.42900000 +1 -1.8790000 +1 -3.4040020 +1 0.0000 Al -2.47700000 +1 1.9470000 +1 1.5770010 +1 0.0000 Si -2.49300000 +1 -1.1750000 +1 1.6130000 +1 0.0000 Si -1.47000000 +1 -3.6580000 +1 6.6100010 +1 0.0000 Al -1.55400000 +1 4.3290000 +1 -6.5800010 +1 0.0000 O -0.01700000 +1 -4.4150000 +1 6.5960000 +1 0.0000 O -2.39800000 +1 -4.5140000 +1 7.6330000 +1 0.0000 O -2.48400000 +1 5.3590000 +1 -5.5150010 +1 0.0000 O -4.66700000 +1 6.8490000 +1 -5.0840010 +1 0.0000 O 0.03900000 +1 5.0730000 +1 6.6290000 +1 0.0000 Al 1.57700000 +1 -3.6710000 +1 6.5570000 +1 0.0000 O -4.09000000 +1 4.8000000 +1 -3.4870020 +1 0.0000 O -4.10000000 +1 -3.9910000 +1 -3.4040020 +1 0.0000 Al -4.05300000 +1 5.2390000 +1 1.5770010 +1 0.0000 Si -4.03600000 +1 -4.6960000 +1 1.6130000 +1 0.0000 Si -3.26500000 +1 -2.9350000 +1 -2.5020000 +1 0.0000 Al -3.26500000 +1 3.5930000 +1 -2.5310000 +1 0.0000 Si -1.47000000 +1 4.3160000 +1 -0.0130000 +1 0.0000 O -2.20600000 +1 -3.7430000 +1 -1.5730000 +1 0.0000 O -2.06800000 +1 4.3710000 +1 -1.5230000 +1 0.0000 O -2.39800000 +1 5.1720000 +1 1.0100000 +1 0.0000 O -2.48400000 +1 -4.7010000 +1 1.1090000 +1 0.0000 O -1.35500000 +1 2.7760000 +1 0.5030000 +1 0.0000 O -1.53900000 +1 -2.0320000 +1 0.6160000 +1 0.0000 O -4.66700000 +1 -6.1910000 +1 1.5390010 +1 0.0000 O -4.32300000 +1 -2.1280000 +1 -1.5730000 +1 0.0000 O -4.99100000 +1 -3.8390000 +1 0.6160000 +1 0.0000 O -4.46200000 +1 2.8150000 +1 -1.5230000 +1 0.0000 O -5.17400000 +1 4.4100000 +1 0.5030000 +1 0.0000 Si -5.06000000 +1 2.8700000 +1 -0.0130000 +1 0.0000 O -4.13200000 +1 2.0150000 +1 1.0100000 +1 0.0000 O -4.04600000 +1 -1.1690000 +1 1.1090000 +1 0.0000 O -1.86200000 +1 0.3200000 +1 1.5390010 +1 0.0000 Si 3.28700000 +1 -2.9350000 +1 -4.1430000 +1 0.0000 Al 3.28700000 +1 3.5929990 +1 -4.1140000 +1 0.0000 Si 5.08200000 +1 2.8700000 +1 6.6160010 +1 0.0000 O 4.34600000 +1 -2.1280000 +1 -5.0720000 +1 0.0000 O 4.48400000 +1 2.8150000 +1 8.1250010 +1 0.0000 O 4.15400000 +1 2.0150000 +1 5.5920010 +1 0.0000 O 4.06800000 +1 -1.1690000 +1 5.4930010 +1 0.0000 O 5.19700000 +1 4.4100000 +1 6.1000010 +1 0.0000 O 5.01300000 +1 -3.8390000 +1 5.9860010 +1 0.0000 O 1.88500000 +1 0.3200000 +1 5.0630010 +1 0.0000 O 2.22900000 +1 -3.7430000 +1 -5.0720000 +1 0.0000 O 1.56100000 +1 -2.0320000 +1 5.9860010 +1 0.0000 O 2.09000000 +1 4.3710010 +1 8.1250010 +1 0.0000 O 1.37800000 +1 2.7760000 +1 6.1000010 +1 0.0000 Si 1.49200000 +1 4.3160000 +1 6.6160010 +1 0.0000 O 2.42000000 +1 5.1720000 +1 5.5920010 +1 0.0000 O 2.50600000 +1 -4.7010000 +1 5.4930010 +1 0.0000 O 4.68900000 +1 -6.1910000 +1 5.0630010 +1 0.0000 O 1.66500000 +1 -6.1760000 +1 -4.1280000 +1 0.0000 O -4.88700000 +1 0.3060000 +1 -2.5170000 +1 0.0000 O -1.64200000 +1 -6.1760000 +1 -2.5170000 +1 0.0000 O 4.90900000 +1 0.3060000 +1 -4.1280000 +1 0.0000 O -1.64200000 +1 -6.2230000 +1 4.1060000 +1 0.0000 O 4.90900000 +1 0.3520000 +1 2.4960000 +1 0.0000 O 1.66500000 +1 -6.2230000 +1 2.4960000 +1 0.0000 O -4.88700000 +1 0.3520000 +1 4.1060000 +1 0.0000 O 5.11800000 +1 -6.2290000 +1 1.8210000 +1 0.0000 O -1.43400000 +1 0.3580000 +1 4.7810000 +1 0.0000 O -5.09600000 +1 -6.2290000 +1 4.7810000 +1 0.0000 O 1.45600000 +1 0.3580000 +1 1.8210000 +1 0.0000 O -5.09600000 +1 -6.1700000 +1 -1.8430000 +1 0.0000 O 1.45600000 +1 0.3000000 +1 -4.8020000 +1 0.0000 O 5.11800000 +1 -6.1700000 +1 -4.8020000 +1 0.0000 O -1.43400000 +1 0.3000000 +1 -1.8430000 +1 0.0000 O 0.01100000 +1 -4.2350000 +1 3.3010010 +1 0.0000 O -6.54100000 +1 -1.6360000 +1 3.3010010 +1 0.0000 O 0.01100000 +1 4.8930000 +1 -3.3220000 +1 0.0000 O -6.54100000 +1 2.2930000 +1 -3.3220000 +1 0.0000 O 0.01100000 +1 4.8210000 +1 3.3010010 +1 0.0000 O -6.54100000 +1 2.3650000 +1 3.3010010 +1 0.0000 O 0.01100000 +1 -4.1640000 +1 -3.3220000 +1 0.0000 O -6.54100000 +1 -1.7070000 +1 -3.3220000 +1 0.0000 H 2.09000000 +1 -7.0190000 +1 2.1250000 +1 0.0000 H -4.46200000 +1 1.1480000 +1 4.4760000 +1 0.0000 H -2.06700000 +1 -7.0190000 +1 4.4760000 +1 0.0000 H 4.48500000 +1 1.1480000 +1 2.1250000 +1 0.0000 H -2.06700000 +1 -5.3800000 +1 -2.1470000 +1 0.0000 H 4.48500000 +1 -0.4900000 +1 -4.4980000 +1 0.0000 H 2.09000000 +1 -5.3800000 +1 -4.4980000 +1 0.0000 H -4.46200000 +1 -0.4900000 +1 -2.1470000 +1 0.0000 H 2.06600000 +1 -5.4230000 +1 2.1210000 +1 0.0000 H -4.48600000 +1 -0.4470000 +1 4.4810000 +1 0.0000 H -2.04300000 +1 -5.4230000 +1 4.4810000 +1 0.0000 H 4.50900000 +1 -0.4470000 +1 2.1210000 +1 0.0000 H -2.04300000 +1 -6.9760000 +1 -2.1430000 +1 0.0000 H 4.50900000 +1 1.1050000 +1 -4.5020000 +1 0.0000 H 2.06600000 +1 -6.9760000 +1 -4.5020000 +1 0.0000 H -4.48600000 +1 1.1050000 +1 -2.1430000 +1 0.0000 H 4.84700000 +1 -7.0120000 +1 2.3290000 +1 0.0000 H -1.70500000 +1 1.1410000 +1 4.2720000 +1 0.0000 H -4.82500000 +1 -7.0120000 +1 4.2720000 +1 0.0000 H 1.72700000 +1 1.1410000 +1 2.3290000 +1 0.0000 H -4.82500000 +1 -5.3870000 +1 -2.3510000 +1 0.0000 H 1.72700000 +1 -0.4830000 +1 -4.2940000 +1 0.0000 H 4.84700000 +1 -5.3870000 +1 -4.2940000 +1 0.0000 H -1.70500000 +1 -0.4830000 +1 -2.3510000 +1 0.0000 H 4.86700000 +1 -5.4730000 +1 2.3830000 +1 0.0000 H -1.68500000 +1 -0.3980000 +1 4.2180000 +1 0.0000 H -4.84500000 +1 -5.4730000 +1 4.2180000 +1 0.0000 H 1.70700000 +1 -0.3980000 +1 2.3830000 +1 0.0000 H -4.84500000 +1 -6.9270000 +1 -2.4050000 +1 0.0000 H 1.70700000 +1 1.0560000 +1 -4.2400000 +1 0.0000 H 4.86700000 +1 -6.9270000 +1 -4.2400000 +1 0.0000 H -1.68500000 +1 1.0560000 +1 -2.4050000 +1 0.0000 H 0.62400000 +1 -3.6940000 +1 2.8090000 +1 0.0000 H -5.92800000 +1 -2.1770000 +1 3.7920000 +1 0.0000 H -0.60200000 +1 -3.6940000 +1 3.7920000 +1 0.0000 H -7.15400000 +1 -2.1770000 +1 2.8090000 +1 0.0000 H -0.60200000 +1 4.3520000 +1 -2.8310000 +1 0.0000 H -7.15400000 +1 2.8350000 +1 -3.8140000 +1 0.0000 H 0.62400000 +1 4.3520000 +1 -3.8140000 +1 0.0000 H -5.92800000 +1 2.8350000 +1 -2.8310000 +1 0.0000 H 0.67100000 +1 4.2740000 +1 2.8790000 +1 0.0000 H -5.88100000 +1 2.9130000 +1 3.7230010 +1 0.0000 H -0.64900000 +1 4.2740000 +1 3.7230010 +1 0.0000 H -7.20100000 +1 2.9130000 +1 2.8790000 +1 0.0000 H -0.64900000 +1 -3.6160000 +1 -2.9000000 +1 0.0000 H -7.20100000 +1 -2.2550000 +1 -3.7450000 +1 0.0000 H 0.67100000 +1 -3.6160000 +1 -3.7450000 +1 0.0000 H -5.88100000 +1 -2.2550000 +1 -2.9000000 +1 0.0000 Tv 0.00000000 +1 0.0000000 +1 13.2470010 +1 Tv 0.00000000 +1 13.0570000 +1 0.0000000 +1 Tv 13.10400000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1

Optimized PM6 data set: MERS=(1,1,1) GNORM=5 Thomsonite Ca 1.54383758 +1 0.3857687 +1 0.1058579 +1 0.0000 Na 0.93305805 +1 -6.2810474 +1 0.1133764 +1 0.0000 Ca -5.14790333 +1 0.9983407 +1 -5.7006840 +1 0.0000 Ca -2.79900680 +1 -6.6015789 +1 -7.0544934 +1 0.0000 Na 4.20356755 +1 0.4257400 +1 -1.3784167 +1 0.0000 Na -2.31328132 +1 -8.0719769 +1 2.8642005 +1 0.0000 Ca 6.08751669 +1 0.8034595 +1 6.6548283 +1 0.0000 Ca -0.56432456 +1 -6.5428456 +1 1.3500456 +1 0.0000 Na -7.27785237 +1 0.3032451 +1 1.5698574 +1 0.0000 Ca -8.48335624 +1 -6.8742141 +1 -1.9004737 +1 0.0000 Ca 1.15836725 +1 -0.4523889 +1 8.0061606 +1 0.0000 Ca -8.50176105 +1 -6.0518576 +1 5.8257240 +1 0.0000 Si 2.28314706 +1 3.5831471 +1 2.4130444 +1 0.0000 Al 3.42420722 +1 -2.4127498 +1 3.4999225 +1 0.0000 Si 1.92623572 +1 -3.6577793 +1 -1.5253146 +1 0.0000 Al 1.50098435 +1 4.0392095 +1 -0.0776230 +1 0.0000 Si 3.88376071 +1 4.8676987 +1 -0.8485365 +1 0.0000 Al 3.31699263 +1 -2.9244232 +1 -0.0430274 +1 0.0000 O 2.16928589 +1 5.2574834 +1 2.9407828 +1 0.0000 O 1.49281163 +1 -3.7479131 +1 0.2259742 +1 0.0000 O 3.78294864 +1 3.2557993 +1 3.1475014 +1 0.0000 O 2.26202949 +1 -3.9152304 +1 3.7866065 +1 0.0000 O 1.87960448 +1 -4.0696609 +1 -3.1369400 +1 0.0000 O 3.37802927 +1 -4.4711258 +1 -1.0555368 +1 0.0000 O 2.24059256 +1 5.1747826 +1 -1.4715551 +1 0.0000 O 2.41288920 +1 -1.9696851 +1 -1.4376786 +1 0.0000 O 0.29751400 +1 2.7343076 +1 -0.5999770 +1 0.0000 O 4.53771048 +1 6.2234763 +1 -0.3795057 +1 0.0000 O 2.21201106 +1 2.4564377 +1 1.1123651 +1 0.0000 O 1.26285473 +1 3.0080236 +1 3.5680186 +1 0.0000 O 3.08214739 +1 4.6604421 +1 0.8479794 +1 0.0000 Si 1.38228304 +1 2.4118845 +1 -1.7759513 +1 0.0000 O 5.25733657 +1 -1.7292402 +1 2.8414593 +1 0.0000 O 2.49041460 +1 -0.8611800 +1 3.6091488 +1 0.0000 O 3.64744362 +1 -3.3886395 +1 1.8389470 +1 0.0000 Al 2.06895287 +1 -2.1937495 +1 -3.3023123 +1 0.0000 O -1.20786971 +1 6.7567588 +1 1.3691010 +1 0.0000 Al -0.16551552 +1 -2.9813245 +1 0.1781837 +1 0.0000 O 4.34421423 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0.0000 Si -1.84604696 +1 2.6580060 +1 -5.9116338 +1 0.0000 Al -1.19774739 +1 -3.0552346 +1 -3.5083460 +1 0.0000 O -4.70466729 +1 2.2252227 +1 1.8223559 +1 0.0000 O -4.28395407 +1 -2.8775527 +1 6.9593088 +1 0.0000 O -2.82454839 +1 2.4523509 +1 0.1371465 +1 0.0000 O -2.36405406 +1 -5.1860397 +1 2.2381482 +1 0.0000 O -5.08729240 +1 -0.4647533 +1 6.2280766 +1 0.0000 O -2.52546546 +1 -0.8873342 +1 7.2924298 +1 0.0000 O -5.00968228 +1 4.4036715 +1 -5.1451166 +1 0.0000 O -4.98984919 +1 -0.9893582 +1 8.6420081 +1 0.0000 O -4.79197463 +1 4.1340237 +1 -7.6600486 +1 0.0000 O -3.35434075 +1 2.2885826 +1 -5.4837078 +1 0.0000 O -2.35378134 +1 3.9636109 +1 2.3558261 +1 0.0000 O -4.32169836 +1 4.4660023 +1 0.5834784 +1 0.0000 O -0.47497460 +1 1.8485583 +1 -5.6560658 +1 0.0000 Si -4.95014262 +1 5.3529269 +1 -6.5449728 +1 0.0000 O -1.50441699 +1 -4.1605277 +1 6.8653091 +1 0.0000 O -5.51225315 +1 -4.4056610 +1 1.2437741 +1 0.0000 O -0.19410090 +1 -2.2860807 +1 8.2424399 +1 0.0000 Al -3.63661211 +1 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